Amplikon-Sequenzierung genetischer Marker für aquatische Umweltproben

LOT-0000 · Amplikon-Sequenzierung genetischer Marker zur Erfassung der Biodiversität und taxonomischen Identifizierung aquatischer Lebensgemeinschaften in Bundeswasserstraßen

Preis

40 %

Liste von maximal 10 Projekten (Auftraggeber, Jahr, Ort, Probenanzahl), welche seit 2022 durch die vorgesehenen Mitarbeitenden mittels Amplikon-Sequenzierung und Illumina-Technologie bearbeitet wurden. Die Probenzahlen dieser zehn ausgewählten Projekte werden aufsummiert und ergeben die Gesamtzahl (n) der berücksichtigten Proben. 10 Punkte: > 10.000 untersuchte Proben 7,5 Punkte: 7.001 - 10.000 untersuchte Proben 5,0 Punkte: 4.001 - 7.000 untersuchte Proben 2,5 Punkte: 1.001 - 4.000 untersuchte Proben 0 Punkte: ≤ 1.000 untersuchte Proben

30 %

zu 1.3a Beschreibung und Dokumentation der Arbeitsabläufe: - Punktevergabe für die beispielhafte Beschreibung und Dokumentation der verwendeten bioinformatischen Prozesse und Methoden inkl. Beschreibung und Nennung der verwendeten Analysepipelines, Software und Datenbanken für eine 16S-rRNA Amplikon-Sequenzdaten-analyse. 10 Punkte: Der Bieter liefert eine allumfassende und detaillierte Beschreibung und Dokumentation der Arbeitsabläufe, inklusive ausführlicher Informationen zu den verwendeten Analyse-Tools und Datenbanken. 7,5 Punkte: Der Bieter legt eine weitgehend vollständige Beschreibung und Dokumentation der Arbeitsabläufe vor, in der die verwendete Software und Datenbanken nachvollziehbar beschrieben sind. 5 Punkte: Der Bieter stellt einen grundlegenden Überblick über die Prozesse bereit, inkl. wesentlicher Informationen zu verwendeten Programmen und Datenbanken jedoch ohne weiterführende Details zur Vorgehensweise. 2,5 Punkte: Der Bieter gibt nur oberflächliche Informationen zu den wesentlichen Arbeitsschritten, die Dokumentation bleibt unvollständig. 0 Punkte: Der Bieter beschränkt sich auf Minimalangaben, ohne strukturierte Beschreibung der eingesetzten Methoden und bioinformatischen Prozesse. zu 1.3b Ergebnisdarstellung: - Punktevergabe für die beispielhafte Darstellung der bioinformatischen Ergebnisse (inkl. klarer visueller Aufbereitung, hohem Informationsgehalt) für eine 16S-rRNA Amplikon-Sequenzdaten-analyse. 10 Punkte: Der Bieter liefert eine hochinformative und leicht verständliche Ergebnispräsentation mit klaren, optisch ansprechenden und inhaltlich fundierten Visualisierungen sowie Tabellen zu allen relevanten Kennzahlen (z. B. reads, OTUs/ASVs, Diversität). Die Darstellungen sind präzise und erlauben eine mühelose Nachvollziehbarkeit der Analysen. 7,5 Punkte: Der Bieter stellt die Analyseergebnisse übersichtlich dar, einschließlich wichtiger Diagramme und Tabellen. Die Erläuterungen sind gut verständlich, könnten aber noch detaillierter ausgeführt werden. 5 Punkte: Der Bieter bringt eine zweckmäßige Darstellung der Analyseergebnisse, in der die Kernpunkte erkennbar sind. Die Darstellungen sind jedoch teilweise unstrukturiert oder enthalten nur grundlegende Erläuterungen. 2,5 Punkte: Der Bieter zeigt nur eine grundlegende Ergebnissammlung mit wenigen, knapp erläuterten Visualisierungen und Tabellen. Relevante Details zu den Analyseergebnissen bleiben weitgehend unklar. 0 Punkte: Der Bieter stellt die Resultate nur in minimaler Form dar, ohne klare Visualisierungen oder nachvollziehbare Erläuterungen.

20 %

Umwelt- und Nachhaltigkeitsmanagement: - Punktevergabe für Nachweise des Bieters in den folgenden drei Kategorien: 1) Kategorie a: Einhaltung umweltrechtlicher Vorschriften (EMAS-Registrierung oder ISO 14001 Zertifizierung) 2) Kategorie b: Überprüfung der Nachhaltigkeit in der Lieferkette (EcoVadis Medaille oder Abzeichen). 3) Kategorie c: Ausschließliche Nutzung von Strom aus erneuerbaren Energien 10 Punkte: Der Bieter verfügt über eine a) EMAS-Registrierung, b) EcoVadis Medaille, und c) nutzt ausschließlich Strom aus erneuerbaren Energien. 7,5 Punkte: Der Bieter verfügt über a) eine EMAS-Registrierung oder ISO 14001 Zertifizierung, b) eine EcoVadis Medaille oder ein EcoVadis Abzeichen, und c) nutzt ausschließlich Strom aus erneuerbaren Energien. 5 Punkte: Der Bieter verfügt über 2 von 3 Nachweisen: a) EMAS-Registrierung oder ISO 14001 Zertifizierung, b) EcoVadis Medaille oder Abzeichen, c) ausschließliche Nutzung von Strom aus erneuerbaren Energien. 2,5 Punkte: Der Bieter verfügt über 1 von 3 Nachweisen: a) EMAS-Registrierung oder ISO 14001 Zertifizierung, b) EcoVadis Medaille oder Abzeichen, c) ausschließliche Nutzung von Strom aus erneuerbaren Energien. 0 Punkte: Der Bieter kann keine der geforderten Nachweise aus den drei o.g. Kategorien erbringen.

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